در راستای تعمیق معرفت دینی و گسترش فرهنگ اسلام ناب محمدی صلی الله علیه و آله و تحقق مطالبات و رهنمودهای مقام معظم رهبری مدظله العالی و اجرای سند تحول آموزش و پرورش، «دفتر همکاری حوزه های علمیه و وزارت آموزش و پرورش» با هدف بهره مندی متقابل از ظرفیت های موجود در نهاد آموزش و پرورش و حوزه های علمیه در عرصه های برنامه ریزی درسی، منابع و متون آموزشی، نیروی انسانی برای آموزش، امور تربیتی و تبلیغ، پژوهش و سایر زمینه های مورد توافق، تشکیل شده است.